哈爾濱工業(yè)大學(xué)計算學(xué)部科研實力雄厚，在國內(nèi)外有很高的知名度。學(xué)部建有5個國家級重點實驗室，2個教育部重點實驗室，3個工信部重點實驗室，22個省級重點實驗室(工程技術(shù)研究中心、協(xié)同創(chuàng)新中心)分布在黑龍江、山東、廣東三省。此外，學(xué)部還擁有3個國際合作實驗室和多個校企聯(lián)合實驗室。每年承擔(dān)國家科技部重點研發(fā)項目，國家自然科學(xué)基金、國際合作項目100余項，年均科研經(jīng)費超過1億元，每年發(fā)表國際期論文200余篇，其中SCI索引論文150篇。自以2001年以來，科研成果獲得國家科技進步一等獎1項，國家自然科學(xué)二等獎1項、國家科技進步二等獎11項、省部級科技進步一等獎20項。

面向國家戰(zhàn)略需求的網(wǎng)絡(luò)與信息安全、智能人機交互、中文信息處理研究、服務(wù)計算與軟件工程、容錯計算技術(shù)、海量數(shù)據(jù)計算，生物信息學(xué)研究形成顯著優(yōu)勢與特色，一批科研成果處于國際領(lǐng)先或先進水平。包括：國家信息安全管理系統(tǒng)、數(shù)字視頻廣播編碼傳輸與接收系統(tǒng)、大規(guī)模網(wǎng)絡(luò)特定信息獲取系統(tǒng)、計算機機群并行數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)、并行數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)、神州飛船數(shù)據(jù)管理分系統(tǒng)、穿戴計算機系統(tǒng)、信息安全與實時監(jiān)測系統(tǒng)、人臉識別系統(tǒng)、視頻編解碼技術(shù)等。